4D-DIA定量蛋白組
▼ 服務介紹
4D-DIA定量蛋白組
4D蛋白質組學技術在傳統的保留時間、質荷比、離子強度的基礎上增加了第四維離子淌度的信息,以研究蛋白質的表達水平,由此獲得蛋白質水平上關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。
產品介紹:
DIA(Data-independent Acquisition,數據非依賴采集)策略則是將質譜整個全掃描范圍分為若干個窗口,并循環地對每個窗口中的所有離子進行選擇、碎裂、檢測,因此可以無遺漏地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息,缺失值更少。但傳統DIA的數據采集策略會使得譜圖高度復雜,給數據解析帶來極大的挑戰,并且其定量可靠性也存有一定的爭議。4D-DIA技術借助timsTOF Pro2特有的雙TIMS設計和DIA-PASEF?采集模式,檢測靈敏度在傳統DIA基礎得到了提升。由于4D-DIA技術的定量信息比傳統DIA多了一維離子淌度信息,使得定量結果更準確,定量可重現性更好。
4D蛋白組原理示意圖
技術優勢
(1)覆蓋度更深,盡量不丟失蛋白質;
(2)定性更準確,結果可信度高;
(3)更穩定,定量更準確,數據更可靠;
(4)通量高,滿足大隊列項目;
(5)低樣本量,更好滿足臨床樣本少等問題。
應用方向:
? 醫學研究
疾病機理機制研究、診斷分子標志物、藥物靶點
? 動物研究
動物生殖發育機制、動物疾病機理、動物營養代謝與調控、動物毒理研究
? 植物研究
植物生殖發育機制、非生物脅迫應答機理、植物抗病機理、作物改良
? 微生物
致病機制及耐藥性研究 脅迫相關蛋白篩查及機制研究 環境作用機理
樣本要求:
適用產品 | 樣本類型 | 樣本 | 推薦送樣量 | 最低送樣量 |
4D-DIA定量蛋白組 |
動物組織 | 常規組織(心、肝、脾、肺等) | 50mg | |
特殊組織(皮膚、毛發、骨頭) | 200mg | |||
植物組織 | 幼嫩組織 | 50mg | ||
成熟組織(樹皮、根、果實) | 1g | |||
花粉 | 40mg | |||
液體 | 血清/血漿(不去除高豐度蛋白) | 20uL | ||
唾液/腦脊液/羊水/乳汁 | 200μL | |||
尿液 | 5mL | |||
細胞上清 | 25mL | |||
唾液/腦脊液/羊水/乳汁 | 200μL | |||
外泌體 | 25μL | |||
細胞 | 原代細胞 | 3×106 | ||
傳代細胞 | 1×106 | |||
其他 | 蛋白質 | 50μg |
研究結論:
該工作采用了4D-蛋白質組方法,揭示了感染初期免疫抑制和COVID-19患者緊密相關。與早期相比,在感染的后期,免疫反應在一定程度上被激活。這些研究提供了與COVID-19疾病相關的分子變化圖譜,并為可能發生的兩期發病機制提供了線索。
客戶支持