代謝組
▼ 服務介紹
【實驗原理】
代謝組學實驗的原理是通過定性鑒別和定量描述生物基質中小分子代謝物的表達與修飾變化,以系統反饋生命體對自身機體調控或外界環境擾動所做出的代謝應答。代謝組學研究的樣本主要包括生物體液和復雜的生物組織或細胞樣本。常用的分析鑒定技術有色譜質譜聯用和核磁共振。
【實驗步驟】
1. 實驗設計
2. 樣品制備
3. 數據采集
4. 數據預處理
5. 多實驗數據集成/數據分析
【常見問題與注意事項】
取樣基本原則
代表性和一致性
實驗組與對照組樣本在取材部位、時間處理等方面盡可能保持一致,從而保證實驗的可信度;
迅速性
操作過程迅速,最大限度縮短樣本采集到實驗的時間;
低溫原則
所有樣本離體后,分離步驟應在4℃或冰上進行,分離好的樣本立即存于-80℃,以免樣本產生進一步代謝活動;
血液樣本收集指南
血清:
1)用促凝管(沒有促凝管則用離心管)收集血液,將促凝管/離心管直立、靜置于試管架上,避免振蕩、摔落;
2)避免陽光直射,室溫;
3)檢查凝血完全后,2500 ~ 3000 rpm,4℃ 低速離心5 min,吸取200 μL上清液至1.5 mL離心管中,若上清液較多可每管200 μL、多管分裝,于-80 ℃凍存待用;
4)嚴禁反復凍融,如發生溶血則該樣本不合格、需重新準備樣本。合格樣本用干冰運輸。
血漿:
1)用抗凝管采血,采血后立刻輕柔上下顛倒8次,使抗凝劑與血液均勻混合(動作輕柔,以避免產生溶血);
2)2500 ~ 3000 rpm,4 ℃低速離心5 min,吸取200 μL上清液分裝至1.5mL離心管中,-80 ℃凍存待用;
3)血液樣本采集后應立即把血漿從全血中分離出來,最晚不遲于采血后1 h內分離出血漿。合格樣本用干冰運輸。
(1)試管的使用
涉及到RNA等的多組學實驗取樣,請勿使用肝素鈉抗凝管(對 RNA 相關實驗有嚴重影響,抑制反轉錄酶活性而導致cDNA量不足);
核磁實驗(NMR)請勿使用EDTA抗凝管(影響圖譜采譜);
代謝實驗取樣不建議使用檸檬酸鈉抗凝管(檸檬酸是TCA循環中的重要物質,使用檸檬酸鈉抗凝劑會引入外源污染),請根據實驗具體情況選用合適的抗凝管。
(2)影響因素
取血時如用酒精消毒,請擦干擦拭部位,待酒精完全揮發后再取樣;
取血時如有使用麻醉劑,建議用異氟醚消毒,以避免在譜圖中出現干擾峰。
(3)產率
血清參考產率:30% ~ 50%(例如:1 mL 全血大約能得 0.3 ~ 0.5 mL 血清)。
血漿參考產率:≈ 50 %(例如:1 mL全血大約能得 0.5 mL 血漿)。
采全血時如使用真空采血管,建議使用促凝管。
(4)凍存管的使用
強烈推薦收集盡量多的樣本并分裝凍存(同批次樣本可以用于多項實驗,且避免反復凍融而導致結果不理想),分裝保存時推薦使用1.5 mL離心管,因為螺口凍存管帽內有一個密封用的橡膠墊圈,長期在-80 ℃/干冰等低溫下,橡膠圈會變硬脆、易脫落,導致管口密封不嚴,樣本滲露。
【交付標準】
1. 實驗報告
2. 真實實驗結果
3. 原始圖片
4. 實驗原始數據
5. 剩余物料在周期內可返還(超過周期,不予返還)
康旭禾生物提供包括動物實驗、細胞實驗、分子實驗、病理實驗、流式檢測實驗及論文翻譯、潤色、投稿輔助等相關的各項服務。
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