曾經叱咤科研界的細胞死亡,小編也是不止一次為大家分享相關的熱點思路,但是現在這類文章在生信領域確實已經相對“泛濫”,想再依靠鐵死亡、自噬、銅死亡等熱點發(fā)篇高分生信文需要在數據和分析思路上有足夠的創(chuàng)新性才行。既然這么卷,咱們?yōu)樯斗且粔K湊熱鬧呢?新熱點不是更香嗎?“乳酸化修飾”就是2024年最火的國自然熱點之一,一出場就是CNS,2025年它的熱度延續(xù),目前Nature各大子刊,例如NC、Cell Research、CDD(Cell Death & Differentiation)等已紛紛發(fā)表了新年的第一篇乳酸化。
第一篇NC
這篇文章于2025年1月8日由南京中醫(yī)藥大學王南溪、中國藥科大學葉慧共同通訊在Nature Communications在線發(fā)表。作者開發(fā)了一個綜合的工作流程,包括通過蛋白組學來識別乳酸化位點,通過遺傳密碼擴增(GCE)來表達活細胞中特定位點的乳酸化蛋白,以及利用綜合功能分析(IFA)平臺來評估其生物學效應。通過蛋白質組學、GCE和生化分析作者研究了ALDOA-K147的乳酸化作用,揭示了其對細胞過程的多種調控作用,包括代謝、核易位和基因調控。 這篇文章多組學(蛋白組學、代謝組學、轉錄組學等)整合,也再次突出了生信技術在如今頂刊文章中的重要應用價值!
第二篇Cell Research
這篇文章是1月6號在線發(fā)表的,由海軍軍醫(yī)大學/中國醫(yī)學科學院/南開大學曹雪濤團隊聯合發(fā)表。研究聚焦免疫代謝的異常激活誘導免疫病理的機制,研究結果揭示了S-D-乳酰谷胱甘肽(SLG)誘導的非酶D-乳酸化的免疫代謝反饋回路,并暗示糖酵解分支途徑中的乙二醛酶II(GLO2)是對抗臨床炎癥疾病的有希望的靶點。
第三篇Cell Death & Differentiation
這篇文章(2025年1月3日發(fā)表)由南京醫(yī)科大學聯合安徽醫(yī)科大學聯合發(fā)表。該研究基于團隊之前的乳酸化蛋白組學研究,篩選了非組蛋白ABCF1為研究對象,揭示了非組蛋白ABCF1-K430乳酸化通過HIF1信號通路的轉錄激活促進肝細胞癌惡性進展。
以上幾篇頂刊文章都是以濕實驗為主,生信分析作為輔助,下面小編再帶大家看一篇近期發(fā)表的生信文章。
這項研究基于GEO數據庫的AMI(急性心梗)的基因表達數據集,采用差異表達分析和WGCNA識別關鍵基因。乳酸化相關基因(LRGs)來自MSigDB數據庫。將差異基因、WGCNA模塊基因以及LRGs取交集獲得了4個關鍵基因。隨后進行無監(jiān)督共識聚類將AMI進行亞型分類,并開發(fā)機器學習模型進行診斷。最終通過SD大鼠原代心肌細胞對4個關鍵基因的表達水平進行驗證。
這篇文章99%都是生信分析,分析方法也是咱們常見的,復現難度比較低。而且該研究最終篩選到了4個關鍵基因,后續(xù)還可以鎖定其中之一進行深入的機制研究,一個不錯的課題就出來了。如果你也對乳酸化感興趣,想復現或個性化定制思路,歡迎直接聯系,專業(yè)團隊為您量身打造最佳思路,主打一個讓您滿意!
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