今天給大家?guī)淼倪@篇文章2023年5月發(fā)表在Cancer Cell上,論文標(biāo)題為“Exhaustion-associated cholesterol deficiency dampens the cytotoxic arm of antitumor immunity”。中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心許琛琦團(tuán)隊(duì)與武漢大學(xué)生科院宋保亮院士團(tuán)隊(duì)合作,研究繪制了腫瘤微環(huán)境中膽固醇圖譜,揭示膽固醇缺乏驅(qū)動(dòng)腫瘤微環(huán)境中T細(xì)胞耗竭和功能障礙的機(jī)制。通過CRISPR-Cas9敲除CAR-T細(xì)胞的LXRβ,能夠解除膽固醇缺乏導(dǎo)致的T細(xì)胞耗竭和功能障礙,從而顯著增強(qiáng)CAR-T的肝癌治療效果。
臨床問題
腫瘤微環(huán)境(TME)中存在各類免疫細(xì)胞:腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞(TILs)可以識(shí)別并殺傷腫瘤細(xì)胞;髓系細(xì)胞,主要是腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)和中性粒細(xì)胞,行使腫瘤促進(jìn)和免疫抑制功能。T淋巴細(xì)胞進(jìn)入腫瘤微環(huán)境后可能會(huì)發(fā)生耗竭和失能,清除腫瘤能力減弱。目前研究發(fā)現(xiàn)造成T細(xì)胞耗竭和失能的原因有:其一是慢性抗原刺激,其二是腫瘤微環(huán)境引發(fā)T細(xì)胞代謝變化。
腫瘤微環(huán)境中的營養(yǎng)限制是導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞免疫逃避的重要因素。葡萄糖是研究廣泛的腫瘤微環(huán)境營養(yǎng)限制因素,其他必需營養(yǎng)素的重要性也在逐漸得到認(rèn)識(shí)。膽固醇作為細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)(包括質(zhì)膜)的重要組成部分,對細(xì)胞增殖至關(guān)重要。癌細(xì)胞通常通過激活SREBP2信號(hào)來上調(diào)膽固醇的生物合成和攝取,以獲得足夠的增殖基礎(chǔ)。基于抑制膽固醇獲取來抑制腫瘤細(xì)胞增殖這一理論,降膽固醇藥物——他汀類藥物,通過抑制膽固醇生物合成中的限速酶HMG-CoA還原酶,用于癌癥治療。
然而其實(shí)際益處并不大,因?yàn)槟[瘤微環(huán)境中各類細(xì)胞的膽固醇水平、實(shí)際效應(yīng)以及腫瘤細(xì)胞與免疫細(xì)胞是否存在膽固醇競爭仍未知,僅僅靶向腫瘤細(xì)胞降低其膽固醇水平容易忽視對其他類型細(xì)胞的影響。因此,需要仔細(xì)評估臨床測試使用的靶向膽固醇代謝藥物對不同類型免疫細(xì)胞有益或有害的作用。對此,我們?nèi)孕璋涯抗夥诺侥[瘤微環(huán)境全局而非僅局限于腫瘤細(xì)胞。
小知識(shí)細(xì)胞的膽固醇代謝主要受兩個(gè)關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子SREBP2和LXR調(diào)控:SREBP2通過調(diào)控膽固醇生物合成和攝取基因來上調(diào)細(xì)胞膽固醇水平;LXR通過調(diào)控膽固醇外排和抑制膽固醇攝取基因來下調(diào)膽固醇水平。
研究內(nèi)容
為了解腫瘤微環(huán)境中淋巴細(xì)胞膽固醇水平變化,以及嘗試對其干預(yù)觀察能否增強(qiáng)抗腫瘤功能,本篇文章對以下兩個(gè)方面進(jìn)行全面而詳細(xì)的探究:查看腫瘤微環(huán)境的膽固醇圖譜→ 鎖定CD8+ T細(xì)胞會(huì)因膽固醇缺乏而丟失 → 了解CD8+ T細(xì)胞對膽固醇需求特性 → 膽固醇缺乏誘導(dǎo)CD8+ T細(xì)胞自噬介導(dǎo)的凋亡 → TME中膽固醇缺乏引發(fā)T細(xì)胞耗竭機(jī)制 → LXR抑制的抗腫瘤作用
①腫瘤微環(huán)境的膽固醇圖譜
在小鼠B16F10腫瘤和人肝癌腫瘤組織中,通過ALOD4-AF647染色測定質(zhì)膜膽固醇水平,通過測量活細(xì)胞吸收熒光標(biāo)記脂蛋白的能力測定不同細(xì)胞群的膽固醇攝取水平。發(fā)現(xiàn)腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞具有較低的膽固醇水平和膽固醇攝取能力。
進(jìn)一步確認(rèn)TILs低膽固醇水平的特殊表現(xiàn),通過過繼轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)比較不同刺激對T細(xì)胞膽固醇水平的影響,發(fā)現(xiàn)腫瘤浸潤性O(shè)T-I T細(xì)胞的膽固醇水平遠(yuǎn)低于疫苗激活的OT-I T細(xì)胞,甚至低于從未受活性抗原刺激的腫瘤小鼠分離的脾OT-I T細(xì)胞。這些數(shù)據(jù)共同表明,TME可以導(dǎo)致TILs中的膽固醇缺乏。
②膽固醇缺乏會(huì)導(dǎo)致腫瘤微環(huán)境中CD8+ T細(xì)胞丟失
使用ScapCKO小鼠模型-特異性從T細(xì)胞中去除SCAP(SREBP2的激活蛋白),抑制膽固醇的獲取。移植MC38結(jié)直腸癌細(xì)胞后檢測TME,發(fā)現(xiàn)CD8+ T細(xì)胞數(shù)量減少,CD4+ T細(xì)胞和Treg數(shù)量未受影響。對數(shù)量減少的PD-1+ CD8+ T 細(xì)胞類群進(jìn)行RNA sequencing,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞增殖分化相關(guān)通路、細(xì)胞周期通路表達(dá)下調(diào)。
③CD8+ T比CD4+ T細(xì)胞更積極參與膽固醇獲取
兩種細(xì)胞針對SCAP缺失的反應(yīng)不一樣,受影響更大的說明更依賴膽固醇。通過測量兩種細(xì)胞的膽固醇代謝和相關(guān)通路:FCM +ALOD4探針測量PM cholesterol水平、擴(kuò)張速率;[14C]acetate pulsing測膽固醇從頭合成比例、脂蛋白攝取速率、膽固醇合成和攝取通路中關(guān)鍵蛋白的表達(dá)(SREBP2&LXR)、細(xì)胞核SREBP2水平、AKT和mTORC1通路水平、ACSS2膽固醇合成起始酶水平。發(fā)現(xiàn)CD8+T細(xì)胞攝取利用膽固醇更高,且驗(yàn)證了AKT-mTORC1-SREBP2信號(hào)通路在CD8+ T細(xì)胞中驅(qū)動(dòng)更活躍的膽固醇獲取,通路和膽固醇可以形成一個(gè)前饋回路。
④CD8+ T比CD4+ T細(xì)胞更易受膽固醇缺乏影響
基于兩種細(xì)胞膽固醇代謝的不同,來查看在膽固醇缺乏時(shí)在細(xì)胞增殖和細(xì)胞存活方面的反應(yīng)如何。通過基因干預(yù)(Scap KO、Ldlr KO)、藥理干預(yù)(lovastatin→抑制近端酶 HMGCR / Ro 48-8071→抑制遠(yuǎn)端酶 OSC)發(fā)現(xiàn),膽固醇缺乏對CD8+T的增殖抑制較強(qiáng),并且導(dǎo)致更多細(xì)胞死亡。
⑤膽固醇缺乏誘導(dǎo)CD8+ T細(xì)胞自噬介導(dǎo)的凋亡
接下來查看CD8+ T細(xì)胞是何種死亡類型。膽固醇缺乏時(shí),檢測到了細(xì)胞凋亡、細(xì)胞自噬特征:capase3/PARP分裂、DNA碎片、核斷裂;ULK1磷酸化降低、LC3b成熟;mTORC1不活躍。進(jìn)行上游-添加膽固醇/下游-凋亡抑制劑和自噬抑制劑功能挽救實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),上游的功能挽救更有效:上游干預(yù)激活mTORC1,下游干預(yù)僅僅阻止caspase-8-caspase-3-PARP激活。比較兩種細(xì)胞的自噬表型,CD8+ T細(xì)胞更顯著。
到此為止,文章確認(rèn)了TME中CD8+ T細(xì)胞膽固醇缺乏,了解CD8+ T細(xì)胞對膽固醇需求特性及缺乏后果。那么,在TME中CD8+ T細(xì)胞膽固醇缺乏的機(jī)制是什么呢?
⑥在耗竭T細(xì)胞中,SREBP2和LXR通路的發(fā)生改變
Ⅰ)確定引發(fā)T細(xì)胞內(nèi)膽固醇水平改變的因素和相關(guān)通路
使用動(dòng)物模型(Huh7異種移植瘤+GPC3.BBZ CAR-T過繼移植)和細(xì)胞模型(Huh7和CAR-T細(xì)胞共培養(yǎng)),通過bulk RNA sequencing 和 RT-qRCR驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),SREBP2通路水平↓和LXR通路水平↑。由于甾醇代謝物如氧化甾醇可以直接調(diào)節(jié)SREBP2和LXR活性,甾醇組學(xué)來測量Huh7 細(xì)胞培養(yǎng)基中的甾醇代謝物發(fā)現(xiàn),培養(yǎng)基含有的27-羥基膽固醇(27-HC)是LXR的一種強(qiáng)效激動(dòng)劑,也可以與INSIG結(jié)合,抑制SREBP2的易位和激活。
Ⅱ)SREBP2/LXR信號(hào)通路和代謝途徑的改變,驅(qū)動(dòng)T細(xì)胞耗竭或功能障礙
使用SREBP2通路抑制劑 (lovastatin or Ro 48-8071)、LXR 通路激活劑 (LXR agonist RGX-104 or GW3965)均能抑制CAR-T細(xì)胞增殖,CAR-T細(xì)胞膽固醇缺乏模型+處理(與腫瘤細(xì)胞共培養(yǎng)+抑制劑/激活劑)下,進(jìn)行bulk RNA seq,LXR↑&SREBP2↓通路改變下調(diào)了缺氧/糖酵解通路和mTORC1活性,上調(diào)了干擾素反應(yīng)。缺氧反應(yīng)促進(jìn)CD8+ T細(xì)胞的抗腫瘤效應(yīng)功能和組織駐留,膽固醇缺乏導(dǎo)致的缺氧反應(yīng)下調(diào)會(huì)減弱抗腫瘤免疫并使T細(xì)胞在缺氧腫瘤微環(huán)境中易受攻擊。糖酵解通路和mTORC1活性下調(diào)會(huì)抑制T細(xì)胞合成代謝與能量生成,影響細(xì)胞分化和存活。上調(diào)的干擾素反應(yīng)會(huì)驅(qū)使T細(xì)胞耗竭,降低ICB療效,并可能進(jìn)一步下調(diào)T細(xì)胞膽固醇水平。
因此,氧甾醇介導(dǎo)的膽固醇水平下降驅(qū)使T細(xì)胞耗竭和功能失調(diào),主要的代謝途徑和信號(hào)通路被揭示。且與慢性抗原刺激導(dǎo)致T細(xì)胞耗竭的機(jī)制(轉(zhuǎn)錄因子TOX/SOX4)不同。
⑦LXRβ缺失促進(jìn)肝癌模型中CAR-T細(xì)胞活性
LXR通路基因在耗竭的T細(xì)胞中表達(dá)改變極大,選中LXR抑制的策略。篩選出LXRβ,敲掉后體內(nèi)外驗(yàn)證,并驗(yàn)證安全性。
總結(jié)
文章系統(tǒng)性地研究了腫瘤微環(huán)境中T淋巴細(xì)胞的膽固醇代謝狀態(tài),為進(jìn)一步通過靶向膽固醇代謝治療腫瘤提供了理論基礎(chǔ)。除此之外,該研究可能也與其他涉及到T細(xì)胞膽固醇代謝的疾病相關(guān)。對于自身免疫和慢性炎癥,過度活化的T細(xì)胞會(huì)導(dǎo)致組織損傷,抑制膽固醇獲得可能通過抑制T細(xì)胞免疫來改善疾病進(jìn)展。進(jìn)一步的研究方向:
① 腫瘤微環(huán)境中其他免疫細(xì)胞類群的膽固醇水平以及對功能的影響;
② T細(xì)胞中膽固醇缺乏是如何導(dǎo)致干擾素反應(yīng)上升的;
③ 只在肝癌模型中進(jìn)行了膽固醇水平修正,在其他類型的癌癥中有待考察;
④ 膽固醇生物合成途徑的另一個(gè)產(chǎn)物-類異戊二烯的功能有待探究。
主營項(xiàng)目
1. 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物飼養(yǎng)、疾病造模、行為學(xué)檢測、心功能、無創(chuàng)血壓、血常規(guī)、全自動(dòng)生化檢測等
2. 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
CCK8/MTT、原代細(xì)胞分離、流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞劃痕、侵襲、遷移、EDU染色、轉(zhuǎn)染、穩(wěn)定株
3. 分子生物學(xué)
PCR檢測、熒光定量PCR、絕對定量PCR、端粒酶長度、pull down、雙熒光素酶、SSR、SNP檢測等
4. 蛋白實(shí)驗(yàn)
WB、Co-IP、酵母雙雜
5. 病理實(shí)驗(yàn)
HE染色、免疫組學(xué)、電鏡
6. 生理生化實(shí)驗(yàn)
肝腎功能、抗氧化、免疫反應(yīng)等生理免疫指標(biāo);動(dòng)植物營養(yǎng)指標(biāo)、微量元素、重金屬、酶活等。
7. 多組學(xué)實(shí)驗(yàn)
基因組、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、蛋白組、代謝組、微生物多樣性、宏基因組、生信分析
8. 整體課題實(shí)驗(yàn)
方案設(shè)計(jì)、整體實(shí)驗(yàn)交付、標(biāo)書寫作、論文潤色、協(xié)助投稿
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