一、常見的內參抗體
1.β-actin(42 kDa)
特點:β-actin 是細胞骨架的重要組成部分,廣泛存在于大多數細胞和組織中,其表達相對穩定,且與眾多目標蛋白的分子量差異較大,便于在 Western blot 實驗中區分。
局限性:在肌肉組織中,β-actin 的高表達可能影響內參的準確性。此外,其聚合狀態易受細胞信號轉導的影響,從而導致表達水平發生變化。因此,在肌肉組織相關研究或涉及細胞信號轉導的實驗中,建議優先選擇其他內參抗體,如 GAPDH 或 β-tubulin。
2.GAPDH(36 kDa)
特點:GAPDH 參與糖酵解等代謝過程,其在多數細胞和組織中表達較為穩定,且與多數目標蛋白的分子量差異較大,便于在 Western blot 實驗中區分。此外,GAPDH 的價格適中,是常用的內參抗體之一。
局限性:在特定條件下,如缺氧等,GAPDH 的表達可能會發生改變。此外,若研究涉及糖代謝相關領域,GAPDH 的表達變化可能會影響內參的準確性。在這種情況下,建議選擇 β-actin 作為替代內參抗體。
3.β-tubulin(55 kDa)
特點:β-tubulin 是細胞微管結構的重要組成部分,其表達相對穩定,能夠與不同分子量的目標蛋白區分,適用于細胞骨架相關研究。
局限性:β-tubulin 的穩定性可能受到藥物處理或細胞生理狀態的影響。在某些特殊細胞類型或疾病模型中,其表達可能不穩定。因此,在這些情況下,GAPDH 可能是更好的選擇。
二、如何選擇內參抗體
1.目的蛋白分子量大小
在選擇內參抗體時,應確保目的蛋白與內參蛋白的分子量相差至少5 kDa,以避免在Western blot實驗中出現條帶重疊,從而確保實驗結果的準確性和可讀性。
2.目的蛋白的細胞定位
①胞漿和全細胞蛋白:可選擇β-actin(42 kDa)、GAPDH或β-tubulin。其中,β-actin在胞漿中表達高效且穩定,但理論上在細胞核內不表達,因此不能作為核蛋白的內參。
②胞核蛋白:可選擇PCNA(GB12010)、Histone H3(GB11102)等,這些蛋白在細胞核中表達穩定,適合作為核蛋白的內參。
③核膜蛋白:可選擇Lamin B1(GB111802),其在核膜中表達穩定,適合作為核膜蛋白的內參。
④線粒體蛋白:可選擇COXIV(GB11250)、VDAC1(GB121939)等,這些蛋白在線粒體中表達穩定,適合作為線粒體蛋白的內參。
3.組織特異性
在脂肪組織中,β-actin的表達量較低,不適合作為內參抗體。
在腦組織中,β-tubulin的表達較高,而β-actin的表達量可能較低,因此建議選擇β-tubulin作為內參。
在骨骼肌、心肌和平滑肌中,β-tubulin的表達可能發生變化或特化,而GAPDH的表達相對穩定,因此建議選擇GAPDH作為內參。
不同組織和細胞類型對內參蛋白的適用性存在差異。例如:
對于其他來源的樣本,如果研究較少,建議參考相關文獻報道,選擇合適的內參蛋白。
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