一、細(xì)胞蛋白提取實驗步驟
1、細(xì)胞處理
①去除培養(yǎng)基
小心棄去六孔板中殘留的細(xì)胞培養(yǎng)基,確保孔板內(nèi)無多余液體,以避免干擾后續(xù)操作。
②PBS清洗
使用預(yù)冷的PBS溶液對細(xì)胞進(jìn)行2 - 3次清洗,每次加入適量PBS后輕輕晃動孔板,使細(xì)胞充分浸潤。隨后,用濾紙輕輕吸干孔板底部的液體,注意避免過度吸干導(dǎo)致細(xì)胞損傷。PBS殘留過多會導(dǎo)致后續(xù)裂解液濃度稀釋,影響裂解效果。
③配制裂解液
在5毫升EP管中配制細(xì)胞裂解液。按100:1:1的體積比將RIPA強裂解液、蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑混合均勻。在加入抑制劑時,將槍頭伸至液面以下,輕輕吹打混勻,確保各成分充分溶解并均勻分布,以防止抑制劑在液面上形成氣泡或分層。
④加入裂解液
向六孔板的每個孔中加入100 - 200微升配制好的RIPA裂解混合液。加入時,從高處逐滴加入,盡量使液體均勻鋪滿孔底,避免局部裂解液濃度過高或過低。隨后將孔板置于冰上靜置15分鐘,以促進(jìn)細(xì)胞充分裂解。
⑤刮取細(xì)胞
使用細(xì)胞刮刀輕輕刮取細(xì)胞,每個孔刮1分鐘。先進(jìn)行水平刮取,再進(jìn)行斜向刮取,確保細(xì)胞完全從孔板表面脫落并匯集至孔底。刮取過程中動作要輕柔,避免過度刮取導(dǎo)致細(xì)胞碎片過多,影響后續(xù)蛋白提取的純度。
⑥收集細(xì)胞
將刮下的細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至1.5毫升EP管中,置于冰上靜置10分鐘,使細(xì)胞進(jìn)一步裂解,釋放出更多的蛋白成分。
2、蛋白提取與純化
①超聲處理
對收集好的細(xì)胞懸液進(jìn)行超聲裂解處理。設(shè)置超聲儀參數(shù)為每次超聲5秒,間隔3秒,重復(fù)4次,功率為25%。超聲過程中需將樣品置于冰浴中,以防止蛋白因高溫變性。超聲處理可進(jìn)一步破碎細(xì)胞,確保細(xì)胞內(nèi)蛋白充分釋放。
②離心分離
將超聲處理后的細(xì)胞懸液在4℃條件下,以12000 - 14000轉(zhuǎn)/分鐘的速度離心15分鐘。離心完成后,小心取出EP管,將上清液轉(zhuǎn)移至新的EP管中,棄去沉淀。上清液中含有可溶性蛋白,是后續(xù)實驗的主要研究對象。
3、蛋白定量與處理
①測定蛋白濃度
從上清液中取2微升樣品,采用BCA法進(jìn)行蛋白濃度測定。準(zhǔn)確測量蛋白濃度是后續(xù)實驗(如SDS-PAGE、Western Blot等)的關(guān)鍵步驟,確保實驗結(jié)果的可靠性和可重復(fù)性。
②加入上樣緩沖液
按照4:1的體積比(蛋白上清液:loading buffer,此處loading buffer為5×)將loading buffer加入蛋白上清液中。例如,100微升蛋白上清液加入25微升loading buffer,充分混勻。上樣緩沖液含有還原劑和染料,可使蛋白在SDS-PAGE電泳中均勻分布并呈現(xiàn)條帶。
4、蛋白保存與后續(xù)處理
①熱處理
將加入上樣緩沖液后的蛋白樣品置于100℃水浴中煮沸10分鐘。煮沸過程中,蛋白會發(fā)生變性,使其在后續(xù)電泳中能夠充分展開并均勻分布。煮沸時需用重物壓住試管蓋,防止蒸汽彈開試管蓋。煮沸完成后,將試管置于桌面上進(jìn)行離心,將冷凝在試管蓋內(nèi)的液體離心至管底,再進(jìn)行后續(xù)混勻操作,以確保樣品均質(zhì),保證實驗結(jié)果的可靠性。
②樣品保存
蛋白樣品易降解,反復(fù)凍融和熱處理后降解風(fēng)險更高。因此,樣品提取后最好分裝保存。每次使用時僅溶解一管,用完即棄。在上樣前再進(jìn)行熱處理效果更佳。樣品可置于-80℃冰箱中保存,以最大限度延長蛋白的穩(wěn)定性。
5、注意事項
①低溫操作:整個實驗過程應(yīng)在低溫環(huán)境下進(jìn)行,以減少蛋白降解的可能性。所有試劑和耗材均需提前置于冰上預(yù)冷。
②裂解液配制:配制裂解液時,需嚴(yán)格按照比例添加各成分,并確保充分混合均勻,以保證裂解效果。避免裂解液長時間暴露在空氣中,防止抑制劑失效。
③細(xì)胞刮取:刮取細(xì)胞時動作要輕柔,避免過度刮取導(dǎo)致細(xì)胞碎片過多,影響后續(xù)實驗結(jié)果。確保細(xì)胞完全脫落并匯集至孔底,避免殘留細(xì)胞影響蛋白提取效率。
④超聲處理:超聲時間不宜過長,以免過度破壞蛋白結(jié)構(gòu),影響后續(xù)分析。超聲過程中需密切觀察樣品狀態(tài),避免產(chǎn)生過多泡沫。
⑤樣品保存:蛋白樣品分裝保存時,盡量減少分裝次數(shù),避免反復(fù)凍融對蛋白造成損傷。每次取用時僅解凍一管,用完即棄,避免反復(fù)凍融。
⑥離心操作:離心時需確保離心機溫度設(shè)置為4℃,以保證蛋白在低溫環(huán)境下穩(wěn)定。離心完成后,小心操作,避免劇烈震蕩導(dǎo)致蛋白沉淀重新懸浮。
⑦蛋白濃度測定:在進(jìn)行BCA法測定蛋白濃度時,需嚴(yán)格按照試劑盒說明書操作,確保標(biāo)準(zhǔn)曲線的準(zhǔn)確性。樣品和標(biāo)準(zhǔn)品的體積需精確測量,以保證結(jié)果的可靠性。
6、常見問題及解決方法
①蛋白降解:如果發(fā)現(xiàn)蛋白樣品出現(xiàn)降解現(xiàn)象,可能是由于裂解液中抑制劑不足或樣品未在低溫環(huán)境下保存。建議增加抑制劑的用量,并嚴(yán)格控制實驗溫度。
②蛋白濃度測定不準(zhǔn)確:如果蛋白濃度測定結(jié)果偏差較大,可能是由于標(biāo)準(zhǔn)曲線制備不準(zhǔn)確或樣品處理不均勻。建議重新制備標(biāo)準(zhǔn)曲線,并在樣品處理過程中增加混勻步驟。
③超聲處理不充分:如果超聲處理后發(fā)現(xiàn)細(xì)胞裂解不完全,可能是由于超聲功率不足或超聲時間過短。建議適當(dāng)增加超聲時間和功率,但需注意避免過度超聲導(dǎo)致蛋白變性
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